コナメガネじゃなくてコネメガネだったと思います

マリはただのユイの後輩の人間ですよ。漫画版には出てきます。
イスカリオテのユダというのが聖書に登場します。裏切り者ですね。
裏切り者という意味なのは補完計画をしていたゲンドウ、冬月、ユイ、マリだったが裏切って補完計画を止める側に回ったのでそう呼ばれていたんだと思います。

中学生のときエヴァに出会い、人間は分かり合えない、だから一つになって煩わしい他人との関わりを無くす、という内容に共感しエヴァの登場人物はどうやっても幸せにはなれない、と思っていました。
学生時代が終わり、就職し、結婚し、子供が生まれその考えは間違っていると実感しました。
言葉で伝えなければ相手は分からないし、自分が知ろうとしなければ相手のことも分からない。分かり合えないんじゃなくて分かろうとする努力が大切なんだということ。それが人間なんだということ。
それをシンジくんは映画の中で理解し、槍を置いて父親と話し合ったときに鳥肌が立ったのを覚えています。
エヴァの人物たちに足りなかったものは「話し合う」という簡単なこと。あぁ、良かった。皆気づいてくれたんだ。話し合って出した答えがエヴァを消す、ということ。これ以上の解決法はないと思います。どんなifストーリーがあったとしても最後にはシンジくんたちが幸せになってくれることが、中学生の自分が絶望していたエヴァの未来であるべきなんです。恐らく延期せず10年前に見ていたとしたら全然違う感想だったと思います。

大体本筋は同じ内容としてまとめておられたと思いましたが、「テレビシリーズのトウジの生存」や「シンエヴァからのセリフの引用」等の誤りが所々見受けられたことや、管理人様寄りの解釈からの考察も多かったため、残念ながらタイトルにある「徹底考察」とは言いにくいのかなと思いました。
出来れば「シンエヴァンゲリオンを見た自分なりの解釈と考察(又は推論)」等と最初に表記していただけていると助かります。

気になったところがいくつかありました。
他の方のコメントでご指摘されているところと類似するところは避けますが、一番気になったところが「旧劇のラストの考察」です。

１.自分も数年前に見たきりで自信はありませんが、確か最後に生き残ったのは「シンジとアスカ」以外にもたくさんいると思います。
確か終盤のLCLの海の中でシンジと綾波が会話していた中で「また誰かがあなたを傷つけることになってもいいの？」「構わない」という会話があり、シンジは全ての人類が一つとなって誰も傷つかない世界から、「これは僕が望んだ世界じゃ無い」と悟り、「辛くてもみんなが笑い合える元の世界の方がいい」と選択していたと思います。
このことから、シンジを傷つける可能性のある人物が不特定多数存在することになることが確定しているかと思います。
管理者様の考察からだと、「生き残ったのはアスカとシンジの2人だけ」と解釈出来てしまいます。
２.また、カヲル君がループしていると言った考察ですが、とても面白くすごいと思う考察でした。確かに「今度こそ君だけは、幸せにしてみせるよ」というセリフからだと「なぜシンジに固執するのか」「カヲルの知られざる過去に幸せに出来なかった人がいて、そこから“今度こそ”というセリフが来ているのか」と色々考えさせられましたが、管理者様の考察が自分には一番しっくりくる考察だなと思い、尊敬の念を感じました。
シンエヴァンゲリオンの最後の大人になった時間軸でのカヲル君と綾波が一緒にいて、ゲンドウとユイが転生して結ばれているように見られるという考察も、とても素晴らしい推察だなと思いました。
確かに2人はシンジ君の両親の模造品とされていましたので、逆に「そういう形でゲンドウの願いも叶っている」と言う解釈と「作者様の理想の親というもの」の推察はとても素晴らしい考察だと思い、ゲンドウに対して少し晴れた気持ちになりました。

しかし、こちらの考察を読ませていただいた限りだと、管理者様の考察では「旧劇から話は繋がっている」と仮定して考察していたように感じられましたが、そうなると「シンジとアスカ2人だけが生き残った世界から新劇場版が始まっていたことになる」と思われます。しかし新劇場版では登場人物はもちろんシンジとアスカ以外にも出ており、シンジもアスカも旧劇から記憶を引き継いでいる描写はないため、その説は難しいかと思います。

３.考察の中にあった“願いが叶う場所「ゴルゴダオブジェクト」にたどり着き、そこで二人は様々な過去の世界を通して、戦うことになります。”とありましたが、あそこにいただけでは願いは叶わないかと思いますので、正確には「シンジ君達の記憶からLCLがシンジ君達が認識できるように作られた仮想世界」が正しいかなと思われます。

４.

他にも「アニメシリーズのトウジ生存」や「新劇場版でのアスカのヒロイン交代説」等の気になったところはありましたが、他の方がコメントでおっしゃっていただけていたので、省略させていただきました。

総合的に、とても面白い考察もあれば、管理者様の解釈に偏った推察もある考察だったと思いました。こちらのサイトから他の方へ広まることも考慮するなら、最初の方に「管理者の解釈、推察に偏った考察となり、全てが事実に即した考察ではありません。」と一言表記していただきたかったと思いました。

まだ他にも、「予告では“8+2号機”」と言っていたのに、長く公開できなかったためか、改善されて8号機と新2号機に分けられて、終盤で「8+9+10+11+12号機」となった理由や、その最後に冬月先生から「キミの欲しいものは用意してある」と言ってあったのが「10,11,12号機」であった理由等を考察したものも投稿していただけると嬉しいです。
自分の考えでは、パリで回収した「オーバーラッピング対応型8号機の改造のパーツ」から複数のエヴァを1体に集約できるようにすることで、どんな場所にでも活動できるようにし、その時のセリフ通り「どこにいても必ず、迎えに行くから」が「8+9+10+11+12号機」となったことで、マイナス宇宙での活動が容易になり、最後にシンジ君を迎えに行けられたのではないかと思います。

アスカがマリをコナメガネというのはコナ○とメガネの短縮語で確信犯だったんだな

冬月はユイの想いを受け継いだ3人の内で自我を捨て最もユイの想いに忠実だった人
ゲンドウはユイの幸せを追求し過ぎてユイの想いの本質を見誤っていた人
マリはユイの想いの本質を理解して自分の行動ができた人

パンドラの箱を開けてしまった世界への贖罪の念はあるのだろうが
ネルフに留まるというよりはゲンドウの側に居続けたのではないかな
その理由はそれがユイの想いの一つだからで
その想いを信じて自我を捨てそれに忠実であった理由はユイの犠牲を伴って判明した世界の理の理解と師弟愛以上の感情があったんだろうね

確かに、すごい納得したありがとう

自分もアスカとケンスケは（あの時点では）親子的な関係だと思う。
ネオジェネ後はエヴァが無くなってて全ての人間関係がまっさらな状態だろうから、彼らがどんな関係を結んでいるか分からないし、そういう部分も含めて「行間を読んでみると楽しいよ」なんじゃないでしょうかね？

とても良くわかります
某銀魂にて「最終回発情現象（ファイナルファンタジー）」と揶揄されていますが、日本のアニメは未だに「男女の恋愛最高」「子ども生まれるの最高」「結ばれて終わるの最高」みたいな風潮が多くて辟易します。

なんでこのコメント欄にいいねボタンがないんや・・・

マイナス宇宙はシンジが見せているものだとしたら、唯一アスカ呼びしていたシンジが、しぬつもりだった自分ではなくてケンスケを見せたのかなって思ってしまうんですよねー。

あと、マリも『姫』、『わんこ君→王子』と呼んでいた2人の仲を裂くとも思えないんですよねー。

エントリープラグでアスカが飛んでった時に「お達者で」ではなくて『待っててね』だったら綺麗に完結できた気がするんですが、、、

え、エンディング中にda capoって表記あったんですか？完っ全に見逃してました。
ラスト、駅から駆け出したあと「終劇」って出たから安心し切ってたよ……。

ところで「残念」と言及されていた虚数宇宙での闘いについて私見を述べさせてください。(長文失礼)

このパートは、頼れる後輩である今石洋之監督(代表作:グレンラガン、キルラキル)による演出と見てほぼ間違いないと思われます。
今石監督の最大の売りは『ストーリーを極限まで圧縮して短時間の作品に詰め込む』こと。
庵野監督が自身で広げておきながら自分で畳めなくなってしまった大風呂敷を「己の弱さを認める」つまり仲間に頼る事で何とか体裁を作った。そういったシーンと考えられます。
尺的にも製作時間的にも(予算的にも)、庵野監督の理想どおりではオーバーすること必至でしょう。
それをファンの「こういうので良いんだよ」な塩梅を見極めてギリギリまで削ぎ落とした。
チャチな3DCGのシーンもダメ出し再発注せず済む様に、それ以外の戦闘シーンにもチープさやコミカルさ、楽屋オチ感を加えて絶妙にバランスをとり、TV版弐十伍・弐十六話との整合性まで持たせ、さらには全てのエヴァとの決別の儀式としての全機串刺しシーン。これぞ今石ワールド。
ああまでハチャメチャな画を描けたのも、庵野監督本人ではないからに他ならないでしょう。

また、シンジとゲンドウの対話シーン。これも庵野監督が逃げ続けて来た宿題でした。これは奥さんである安野モヨコさんの仕事ですかね。ここまでベタでガチな対話が見られるとは思っていなかったので収穫でした。

最低限に留めた伏線回収と、ベストな塩梅の各キャラの独白。作品全体として見ると繋がりの悪いチグハグなシーンですが、強引ながらも見事に完結させた実にスバラシイ仕事だと、別の意味で感動しました。

庵野監督がこれまで抱えていた宿題は、みんなの協力で全部提出されてましたね。
間違いなく私の人生の一部にもしっかりとピリオドが刻まれました。

アスカは初恋の相手でもあるけど、同時にシンジ君の自分の理想そのものだったんですね。

シンジくんがキリストであり、世界の創造主となったとしたら、最後にアダムとリリスの対立もなくなり、また、アダムとリリスが地球にやってきた理由もシンジくんに会いたかったからなのかな？と思ったりしました。

ありがとうございました！

それから、アニメ放送時から見ておりましたが、コメントにもありますが、気持ち悪いはその時の宮村さんの気持ちであって、当時監督はインタビューで、アスカがシンジの頭を優しく触る様子を見てください。愛情がありますと言っていたので、あの旧劇はアスカとシンジが結ばれるとみて良いかと。

旧劇において、シンジはアスカでマスター〇ーションをしており、性欲対象と見ています。また、NHK BSで放送されたアニメ夜話で、この行為に対して宮村さんは「気持ち悪い」という感想を監督に述べたと話しており、このことから旧劇アスカの最後のセリフが決まったと放送されていました。（１０年以上前の放送で確かめられませんが・・・。）
さらに、アスカとシンジは本作中において、過去に好きだった人と互いに認めています。

以上から、シンジにとってアスカは思春期における思い出の初恋？の対象であり、かつ性欲の対象であったのですが、大人になった（一般的に大人は性欲を制御できる）シンジにとって、最早アスカはパートナーの対象にはならないということでしょう。

自分自身を慰めてくれる「自分」という解釈は行き過ぎな気がしますし、一般的に自分と正反対の性格の異性は、理想の異性と解釈されるかと思います。
自分のやることを決断できるアスカは、一見優柔不断なシンジにとって理想の異性でしたが、本作中後半の自己決断できるシンジにとっては、性格が反対の異性ではなくなってしまい、理想の異性ではなくなっています。

加えて、マスター〇ーションはキリスト教において罪の行為とされていますが、罪の対象であるアスカを送り出すことは、シンジにとっては清算した過去とも解釈できると思いました。
（シンジとアスカがカップリングしてしまうと、シンジは以後も罪を負わなければならない？）

イチおっさんの解釈として、参考にしていただければ幸いです。

（大人の男性にとって、厨二のマスター〇ーションを思い出すなんて恥ずかしい記憶・原罪・ほろ苦い思い出・・・です。）

俺もアスカ好きだから気持ちは分かる。
だが、これこそ庵野秀明の言う現実を見ろ、だと思う。
好きな女が他の男と結ばれようとも、その女が幸せなら選んだなら、それを祝福してやるのが男ってもんだ。

とか言ってみたけど、なんか一部の考察だと庵野秀明が宮村さんとか林原めぐみさんにフラれたから、あえてヒロインから外したとかあって、俺的にはそっちの方が嫌だ（笑）。

やっと見れたシンエヴァ面白かった！
でも、全然分からなかったから、考察ゆっくり読んで2回目見に行きます！

ありがとうございます(*´`)混同してました。訂正させていただきます！

貞本版では死んでしまったけど

ダ・カーポ記号は、もう一度最初から演奏して、fineまでで終了だから、
囲まれてるのを序からと見れば、序から今作までもう一度繰り返して、その後にエンディングクレジットのダ・カーポで、もう一度テレビシリーズのエヴァンゲリオンに戻って、最後のfinは、旧劇場版のエヴァンゲリオンで演奏終了かなと思ってる。

つまり、結局は救われない。

というのは考えすぎで、単純にリピートでもう一度テレビシリーズから最後までやり直して、今作で終了したよ、でも、また始まるよ、このループはずっとあるんだよ＝エヴァンゲリオンは終わらない、がメッセージのような気もしてる。

アヤナミレイも渚カヲルも含めてやり直しがエンドレスエイトなのが、実はエヴァンゲリオン。